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透过系统发生树了解癌症进化“森林”
Seeing the Forest through the Phylogenetic Tree


Ana I. Robles ... 肿瘤 • 2017.05.01
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通常情况下,癌症被认为是一种基因疾病。肿瘤的发生是基因改变(基因突变、拷贝数改变、基因融合或者RNA过表达或低表达)累积,影响单个细胞的特性,并赋予其生长优势所导致的结果。早期,这一分步路径被描述为连续获得突变导致肿瘤进展的线性模型1。如今,人们清楚地认识到,向恶性程度越来越高的表型进化的过程是一个复杂、多层次的过程。在这一过程中,基因组改变随机积累产生不同的、彼此竞争的单克隆。环境压力,如用于治疗患者的疗法施加的压力2,选择有适应性的单克隆。尽管在单一时间点进行的肿瘤调查(如肿瘤基因组图谱,the Cancer Genome Atlas [TCGA])间接支持这一肿瘤进展模型,但迄今,没有任何一个研究方案直接探究肿瘤异质性、进化和治疗抗性的问题。





作者信息

Ana I. Robles, Ph.D., and Jean C. Zenklusen, Ph.D.
From the Laboratory of Human Carcinogenesis, Center for Cancer Research (A.I.R.), and the Center for Cancer Genomics (J.C.Z.), National Cancer Institute, National Institutes of Health, Bethesda, MD.

 

参考文献

1. Fearon ER, Vogelstein B. A genetic model for colorectal tumorigenesis. Cell 1990;61:759-767

2. Turner NC, Reis-Filho JS. Genetic heterogeneity and cancer drug resistance. Lancet Oncol 2012;13:e178-e185

3. Jamal-Hanjani M, Hackshaw A, Ngai Y, et al. Tracking genomic cancer evolution for precision medicine: the lung TRACERx study. PLoS Biol 2014;12:e1001906-e1001906

4. Cancer Genome Atlas Research Network. Comprehensive genomic characterization of squamous cell lung cancers. Nature 2012;489:519-525

5. Cancer Genome Atlas Research Network. Comprehensive molecular profiling of lung adenocarcinoma. Nature 2014;511:543-550

6. Jamal-Hanjani M, Wilson GA, McGranahan N, et al. Tracking the evolution of non–small-cell lung cancer. N Engl J Med 2017;376:2109-2121

7. Abbosh C, Birkbak NJ, Wilson GA, et al. Phylogenetic ctDNA analysis depicts early stage lung cancer evolution. Nature 2017 April 26 (Epub ahead of print)

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