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2019年从中国肺炎患者分离出的新型冠状病毒
A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019


Na Zhu ... 呼吸系统疾病 • 2020.02.20
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近期发表的3篇新型冠状病毒临床研究汇总

 

张祎

中日友好医院呼吸中心;中国医学科学院呼吸病学研究院;呼吸疾病国家呼吸临床研究中心

 

2019年12月27日武汉市出现3例不明原因肺炎患者,支气管肺泡灌洗标本送检新一代测序,发现新型冠状病毒,全基因组序列与造成SARS流行的蝙蝠来源冠状病毒序列一致性超过85%。

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摘要


2019年12月,中国武汉出现与海鲜批发市场相关的不明原因肺炎的聚集性病例。对肺炎患者样本进行全基因组测序后发现了一种从未见过的乙型冠状病毒属(betacoronavirus)病毒。该病毒从感染者气道上皮细胞中分离出,随后被命名为2019-nCoV,它属于正冠状病毒亚科(Orthocoronavirinae subfamily)的Sarbe冠状病毒亚属(subgenus sarbecovirus),但形成了另外一簇的进化分支。2019-nCoV与MERS-CoV和SARS-CoV都不同,它成为可以感染人类的冠状病毒科中的第7个成员。对该病毒的加强监控和进一步的研究正在进行中(由中国国家重点研发项目和国家传染病防治重大专项资助)。

新出现和再度出现的病原体全球公共卫生面临挑战1。冠状病毒是一种有包膜的RNA病毒,广泛存在于人类、哺乳动物和鸟类宿主中,可以导致呼吸道、肠道、肝脏和神经系统疾病2,3。目前已知6个冠状病毒属可对人类致病4,其中以229E、OC43、NL63和HKU1为主,可以导致免疫功能正常的宿主发生普通感冒症状4;另外两种病毒:严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)和中东呼吸综合征病毒(MERS-CoV),引起人畜共患传染病,有时可发生致死性疾病5。SARS-CoV是中国广东2002—2003年间暴发的严重急性呼吸综合征的病原体6-8,而MERS-CoV是2012年中东地区暴发的严重呼吸道疾病的病原体9。鉴于冠状病毒的高流行率和广泛分布,其基因组的巨大遗传多样性和频繁重组,以及人-动物间接触活动的增加,新型冠状病毒可能因频繁的跨物种感染和偶尔的动物传人事件而周期性地出现在人类面前5,10

2019年12月末,武汉几家卫生机构报道了不明原因肺炎的聚集性病例,这些病例在流行病学上与武汉一家海鲜和生鲜批发市场相关11。12月31日,中国疾病预防控制中心(中国CDC)派出快速反应小组,会同湖北省和武汉市卫生机构进行了流行病学和病原学调查。我们在疫情早期报道了这项调查的结果,确定了肺炎聚集性病例的来源,并描述了中国CDC在肺炎患者中检出的一种新型冠状病毒。我们还描述了其中2例患者的肺炎临床特征。





作者信息

Na Zhu, Ph.D., Dingyu Zhang, M.D., Wenling Wang, Ph.D., Xingwang Li, M.D., Bo Yang, M.S., Jingdong Song, Ph.D., Xiang Zhao, Ph.D., Baoying Huang, Ph.D., Weifeng Shi, Ph.D., Roujian Lu, M.D., Peihua Niu, Ph.D., Faxian Zhan, Ph.D., Xuejun Ma, Ph.D., Dayan Wang, Ph.D., Wenbo Xu, M.D., Guizhen Wu, M.D., George F. Gao, D.Phil., and Wenjie Tan, M.D., Ph.D. for the China Novel Coronavirus Investigating and Research Team
From the NHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention (N.Z., W.W., J.S., X.Z., B.H., R.L., P.N., X.M., D.W., W.X., G.W., G.F.G., W.T.), and the Department of Infectious Diseases, Beijing Ditan Hospital, Capital Medical University (X.L.) — both in Beijing; Wuhan Jinyintan Hospital (D.Z.), the Division for Viral Disease Detection, Hubei Provincial Center for Disease Control and Prevention (B.Y., F.Z.), and the Center for Biosafety Mega-Science, Chinese Academy of Sciences (W.T.) — all in Wuhan; and the Shandong First Medical University and Shandong Academy of Medical Sciences, Jinan, China (W.S.). Address reprint requests to Dr. Tan at the NHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, China CDC, 155 Changbai Road, Changping District, Beijing 102206, China; or at tanwj@ivdc.chinacdc.cn, Dr. Gao at the National Institute for Viral Disease Control and Prevention, China CDC, Beijing 102206, China, or at gaof@im.ac.cn, or Dr. Wu at the NHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, China CDC, Beijing 102206, China, or at wugz@ivdc.chinacdc.cn.

 

参考文献

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4. Su S, Wong G, Shi W, et al. Epidemiology, genetic recombination, and pathogenesis of coronaviruses. Trends Microbiol 2016;24:490-502.

5. Cui J, Li F, Shi ZL. Origin and evolution of pathogenic coronaviruses. Nat Rev Microbiol 2019;17:181-192.

6. Zhong NS, Zheng BJ, Li YM, et al. Epidemiology and cause of severe acute respiratory syndrome (SARS) in Guangdong, People’s Republic of China, in February, 2003. Lancet 2003;362:1353-1358.

7. Ksiazek TG, Erdman D, Goldsmith CS, et al. A novel coronavirus associated with severe acute respiratory syndrome. N Engl J Med 2003;348:1953-1966.

8. Drosten C, Günther S, Preiser W, et al. Identification of a novel coronavirus in patients with severe acute respiratory syndrome. N Engl J Med 2003;348:1967-1976.

9. Zaki AM, van Boheemen S, Bestebroer TM, Osterhaus AD, Fouchier RA. Isolation of a novel coronavirus from a man with pneumonia in Saudi Arabia. N Engl J Med 2012;367:1814-1820.

10. Wong G, Liu W, Liu Y, Zhou B, Bi Y, Gao GF. MERS, SARS, and Ebola: the role of super-spreaders in infectious disease. Cell Host Microbe 2015;18:398-401.

11. Report of clustering pneumonia of unknown etiology in Wuhan City. Wuhan Municipal Health Commission, 2019. (http://wjw.wuhan.gov.cn/front/web/showDetail/2019123108989. opens in new tab).

12. Liu GS, Li H, Zhao SC, Lu RJ, Niu PH, Tan WJ. Viral and bacterial etiology of acute febrile respiratory syndrome among patients in Qinghai, China. Biomed Environ Sci 2019;32:438-445.

13. Jonsdottir HR, Dijkman R. Coronaviruses and the human airway: a universal system for virus-host interaction studies. Virol J 2016;13:24-24.

14. Palacios G, Druce J, Du L, et al. A new arenavirus in a cluster of fatal transplant-associated diseases. N Engl J Med 2008;358:991-998.

15. Tan WJ, Zhao X, Ma XJ, et al. A novel coronavirus genome identified in a cluster of pneumonia cases — Wuhan, China 2019−2020. China CDC Weekly 2020;2:61-62.

16. Armstrong GL, MacCannell DR, Taylor J, et al. Pathogen genomics in public health. N Engl J Med 2019;381:2569-2580.

17. Report of novel coronavirus-infected pneumonia in Wuhan City. Wuhan Municipal Health Commission, 2020 (http://wjw.wuhan.gov.cn/front/web/showDetail/2020012009077. opens in new tab).

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